Project measure / variable:   Project1124   Asaccharobacter_pos

ID, description, units MPD:114975   Asaccharobacter_pos   Asaccharobacter   [%]  pos  
cocaine study
Data set, strains Project1124   CC   38 strains     sex: both
Procedure 16S rRNA Sequencing
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  STRAIN COMPARISON PLOT
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Project1124 - Asaccharobacter pos



  MEASURE SUMMARY
Measure Summary FemaleMale
Number of strains tested34 strains33 strains
Mean of the strain means0.00252822   % 0.00127015   %
Median of the strain means0.0   % 0.0   %
SD of the strain means± 0.00664525 ± 0.00416549
Coefficient of variation (CV)2.6284 3.2795
Min–max range of strain means0.0   –   0.02541   % 0.0   –   0.02045   %
Mean sample size per strain1.0   mice 1.0   mice


  STRAIN MEANS (UNADJUSTED)
  
Select table page:
Strain Sex Mean SD N mice SEM CV Min, Max Z score
CC001/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC001/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC002/UncJ f 0.00313362 0.0   1   0.0 0.0 0.00313362, 0.00313362 0.09
CC002/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC003/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC003/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC004/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC005/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC005/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC007/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC008/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC008/GeniUncJ m 0.00459474 0.0   1   0.0 0.0 0.00459474, 0.00459474 0.8
CC009/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC009/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC010/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC011/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC011/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC012/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC012/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC013/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC013/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC016/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC017/UncJ f 0.02427 0.0   1   0.0 0.0 0.02427, 0.02427 3.27
CC017/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC018/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC018/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC019/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC020/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC020/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC023/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC023/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC026/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC026/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC027/GeniUncJ f 0.01307 0.0   1   0.0 0.0 0.01307, 0.01307 1.59
CC027/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC028/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC028/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC029/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC030/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC030/GeniUncJ m 0.02045 0.0   1   0.0 0.0 0.02045, 0.02045 4.6
CC033/GeniUncJ f 0.02541 0.0   1   0.0 0.0 0.02541, 0.02541 3.44
CC033/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC035/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC035/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC036/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC036/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC040/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC041/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC044/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC044/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC045/GeniUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC045/GeniUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC057/UncJ f 0.01541 0.0   1   0.0 0.0 0.01541, 0.01541 1.94
CC057/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC068/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC068/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC074/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC075/UncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC075/UncJ m 0.00477031 0.0   1   0.0 0.0 0.00477031, 0.00477031 0.84
CC079/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC079/TauUncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC080/TauUncJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC080/TauUncJ m 0.0121 0.0   1   0.0 0.0 0.0121, 0.0121 2.6
CC083/UncJ f 0.00466592 0.0   1   0.0 0.0 0.00466592, 0.00466592 0.32
CC083/UncJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3
CC084/TauJ f 0.0 0.0   1   0.0 None -0.38
CC084/TauJ m 0.0 0.0   1   0.0 None -0.3




GWAS analysis not available: Strain panel must be either Inbred, HMDP, BXD, BXH, CXB, or AXB/BXA